Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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