Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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