Protein–RNA interactions for Protein: A2RU37

C9orf170, Uncharacterized protein C9orf170, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170A2RU37 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf170A2RU37 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms