Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms