Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
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