Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms