Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms