Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SH3BP1Q9Y3L3 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms