Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X0

MED16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, humanhuman

Predictions only

Length 877 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16Q9Y2X0 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms