Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRPF3Q9ULD4 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms