Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms