Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms