Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms