Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms