Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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VAPAQ9P0L0 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VAPAQ9P0L0 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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