Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms