Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSU72Q9NP77 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms