Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms