Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CEP44Q9C0F1 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms