Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM55Q9BYV6 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms