Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCGF6Q9BYE7 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92 ms