Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP2

SLC12A9, Solute carrier family 12 member 9, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A9Q9BXP2 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC12A9Q9BXP2 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC12A9Q9BXP2 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC12A9Q9BXP2 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC12A9Q9BXP2 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC12A9Q9BXP2 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC12A9Q9BXP2 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC12A9Q9BXP2 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC12A9Q9BXP2 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC12A9Q9BXP2 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC12A9Q9BXP2 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC12A9Q9BXP2 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC12A9Q9BXP2 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC12A9Q9BXP2 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC12A9Q9BXP2 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC12A9Q9BXP2 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC12A9Q9BXP2 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC12A9Q9BXP2 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC12A9Q9BXP2 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC12A9Q9BXP2 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC12A9Q9BXP2 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC12A9Q9BXP2 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC12A9Q9BXP2 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC12A9Q9BXP2 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC12A9Q9BXP2 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC12A9Q9BXP2 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC12A9Q9BXP2 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A9Q9BXP2 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A9Q9BXP2 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A9Q9BXP2 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A9Q9BXP2 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A9Q9BXP2 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A9Q9BXP2 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A9Q9BXP2 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A9Q9BXP2 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A9Q9BXP2 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A9Q9BXP2 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A9Q9BXP2 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A9Q9BXP2 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A9Q9BXP2 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A9Q9BXP2 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A9Q9BXP2 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A9Q9BXP2 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A9Q9BXP2 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A9Q9BXP2 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A9Q9BXP2 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A9Q9BXP2 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A9Q9BXP2 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A9Q9BXP2 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A9Q9BXP2 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A9Q9BXP2 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A9Q9BXP2 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A9Q9BXP2 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A9Q9BXP2 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A9Q9BXP2 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A9Q9BXP2 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A9Q9BXP2 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A9Q9BXP2 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A9Q9BXP2 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A9Q9BXP2 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A9Q9BXP2 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A9Q9BXP2 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A9Q9BXP2 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC12A9Q9BXP2 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC12A9Q9BXP2 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC12A9Q9BXP2 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC12A9Q9BXP2 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC12A9Q9BXP2 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC12A9Q9BXP2 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC12A9Q9BXP2 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC12A9Q9BXP2 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC12A9Q9BXP2 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC12A9Q9BXP2 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC12A9Q9BXP2 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC12A9Q9BXP2 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC12A9Q9BXP2 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC12A9Q9BXP2 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC12A9Q9BXP2 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC12A9Q9BXP2 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC12A9Q9BXP2 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC12A9Q9BXP2 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC12A9Q9BXP2 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC12A9Q9BXP2 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC12A9Q9BXP2 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC12A9Q9BXP2 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC12A9Q9BXP2 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC12A9Q9BXP2 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC12A9Q9BXP2 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC12A9Q9BXP2 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC12A9Q9BXP2 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC12A9Q9BXP2 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC12A9Q9BXP2 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC12A9Q9BXP2 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC12A9Q9BXP2 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC12A9Q9BXP2 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC12A9Q9BXP2 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC12A9Q9BXP2 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC12A9Q9BXP2 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC12A9Q9BXP2 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC12A9Q9BXP2 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms