Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PLVAPQ9BX97 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms