Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV87

CNPPD1, Protein CNPPD1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPPD1Q9BV87 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CNPPD1Q9BV87 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms