Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms