Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms