Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms