Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 SRRT-216ENST00000618262 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 MCL1-204ENST00000620947 3626 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 AC092068.1-201ENST00000592525 454 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms