Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

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Length 751 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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