Protein–RNA interactions for Protein: Q96P69

GPR78, G-protein coupled receptor 78, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR78Q96P69 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPR78Q96P69 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms