Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms