Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms