Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.2 ms