Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY5

MVB12A, Multivesicular body subunit 12A, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12AQ96EY5 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms