Protein–RNA interactions for Protein: Q96EM0

L3HYPDH, Trans-3-hydroxy-L-proline dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L3HYPDHQ96EM0 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
L3HYPDHQ96EM0 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms