Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC9

OTUB2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB2Q96DC9 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
OTUB2Q96DC9 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
OTUB2Q96DC9 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
OTUB2Q96DC9 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
OTUB2Q96DC9 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
OTUB2Q96DC9 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
OTUB2Q96DC9 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
OTUB2Q96DC9 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
OTUB2Q96DC9 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
OTUB2Q96DC9 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms