Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.4 ms