Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HPS3Q969F9 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms