Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 APOBEC3H-201ENST00000348946 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms