Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBU5

ATAD1, ATPase family AAA domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD1Q8NBU5 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD1Q8NBU5 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms