Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM71DQ8N9W8 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms