Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNAAF3Q8N9W5 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms