Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms