Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW8

HAPLN4, Hyaluronan and proteoglycan link protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN4Q86UW8 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HAPLN4Q86UW8 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms