Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD4L3Q6VB84 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms