Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms