Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC13□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC13□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC13□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC13□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC13□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC13□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC13□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC13□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC13□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC13□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DUX4L9Q6RFH8 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms