Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
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