Protein–RNA interactions for Protein: Q68J44

DUPD1, Dual specificity phosphatase DUPD1, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUPD1Q68J44 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DUPD1Q68J44 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUPD1Q68J44 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms