Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 PRR34-AS1-203ENST00000451166 877 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 MAD2L1BP-201ENST00000372171 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 PLA2G2A-201ENST00000375111 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 SLC9A3R2-204ENST00000563587 1037 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 AC020922.4-201ENST00000621389 339 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 TGFBI-207ENST00000508076 1034 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 LAMTOR1-208ENST00000545249 965 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 DIO3OS-211ENST00000557532 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 AC080013.5-201ENST00000607044 679 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 MIEF1-215ENST00000637854 213 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FAM208BQ5VWN6 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms